Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVF3

PCID2, PCI domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCID2Q5JVF3 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms