Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI63

KRTAP20-1, Keratin-associated protein 20-1, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP20-1Q3LI63 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
KRTAP20-1Q3LI63 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
KRTAP20-1Q3LI63 HNF4A-206ENST00000457232 1339 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
KRTAP20-1Q3LI63 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
KRTAP20-1Q3LI63 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
KRTAP20-1Q3LI63 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
KRTAP20-1Q3LI63 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
KRTAP20-1Q3LI63 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
KRTAP20-1Q3LI63 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
KRTAP20-1Q3LI63 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
KRTAP20-1Q3LI63 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
KRTAP20-1Q3LI63 APOC3-201ENST00000227667 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
KRTAP20-1Q3LI63 C11orf53-201ENST00000280325 1208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
KRTAP20-1Q3LI63 SYNGR4-201ENST00000344846 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
KRTAP20-1Q3LI63 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
KRTAP20-1Q3LI63 GEMIN8P4-201ENST00000380526 729 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
KRTAP20-1Q3LI63 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
KRTAP20-1Q3LI63 TUBB2BP1-201ENST00000404155 871 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
KRTAP20-1Q3LI63 LDHAL6FP-201ENST00000405916 1082 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
KRTAP20-1Q3LI63 LINC00388-201ENST00000412714 663 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
KRTAP20-1Q3LI63 MRPS16P3-201ENST00000415961 374 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
KRTAP20-1Q3LI63 AL121892.1-201ENST00000422574 833 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
KRTAP20-1Q3LI63 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
KRTAP20-1Q3LI63 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
KRTAP20-1Q3LI63 AP000346.2-201ENST00000430707 906 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
KRTAP20-1Q3LI63 CCND3P1-201ENST00000438347 580 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
KRTAP20-1Q3LI63 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
KRTAP20-1Q3LI63 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
KRTAP20-1Q3LI63 MYLK-AS1-203ENST00000485162 587 ntTSL 4 BASIC5.54□□□□□ -1.52
KRTAP20-1Q3LI63 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
KRTAP20-1Q3LI63 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
KRTAP20-1Q3LI63 AP003040.1-201ENST00000532044 1024 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
KRTAP20-1Q3LI63 AL049871.1-201ENST00000557475 880 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
KRTAP20-1Q3LI63 AC079414.2-201ENST00000567157 1104 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
KRTAP20-1Q3LI63 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
KRTAP20-1Q3LI63 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
KRTAP20-1Q3LI63 B9D1-213ENST00000575403 928 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
KRTAP20-1Q3LI63 ACSM5-206ENST00000575584 1130 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
KRTAP20-1Q3LI63 TRMT112P3-201ENST00000580149 358 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
KRTAP20-1Q3LI63 RN7SL322P-201ENST00000583519 299 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
KRTAP20-1Q3LI63 AC015818.3-201ENST00000583797 589 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
KRTAP20-1Q3LI63 RPL26-209ENST00000584164 873 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
KRTAP20-1Q3LI63 AC090409.1-202ENST00000586949 653 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
KRTAP20-1Q3LI63 NMRK2-202ENST00000593949 869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
KRTAP20-1Q3LI63 AC010524.1-201ENST00000596488 494 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
KRTAP20-1Q3LI63 TRMT112P6-201ENST00000599234 372 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
KRTAP20-1Q3LI63 NMRK2-204ENST00000599576 691 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
KRTAP20-1Q3LI63 DUX4L33-201ENST00000635217 958 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
KRTAP20-1Q3LI63 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
KRTAP20-1Q3LI63 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
KRTAP20-1Q3LI63 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
KRTAP20-1Q3LI63 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
KRTAP20-1Q3LI63 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
KRTAP20-1Q3LI63 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
KRTAP20-1Q3LI63 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
KRTAP20-1Q3LI63 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
KRTAP20-1Q3LI63 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
KRTAP20-1Q3LI63 C1QTNF3-201ENST00000231338 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
KRTAP20-1Q3LI63 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
KRTAP20-1Q3LI63 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
KRTAP20-1Q3LI63 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
KRTAP20-1Q3LI63 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
KRTAP20-1Q3LI63 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
KRTAP20-1Q3LI63 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
KRTAP20-1Q3LI63 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
KRTAP20-1Q3LI63 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
KRTAP20-1Q3LI63 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
KRTAP20-1Q3LI63 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
KRTAP20-1Q3LI63 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
KRTAP20-1Q3LI63 DLST-202ENST00000334220 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
KRTAP20-1Q3LI63 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
KRTAP20-1Q3LI63 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
KRTAP20-1Q3LI63 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
KRTAP20-1Q3LI63 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
KRTAP20-1Q3LI63 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
KRTAP20-1Q3LI63 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
KRTAP20-1Q3LI63 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
KRTAP20-1Q3LI63 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP20-1Q3LI63 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP20-1Q3LI63 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP20-1Q3LI63 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP20-1Q3LI63 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP20-1Q3LI63 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP20-1Q3LI63 MBIP-211ENST00000621657 1809 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP20-1Q3LI63 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP20-1Q3LI63 AC026271.1-201ENST00000447794 1348 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP20-1Q3LI63 C1orf87-202ENST00000450089 1307 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP20-1Q3LI63 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP20-1Q3LI63 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP20-1Q3LI63 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP20-1Q3LI63 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP20-1Q3LI63 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP20-1Q3LI63 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP20-1Q3LI63 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP20-1Q3LI63 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP20-1Q3LI63 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP20-1Q3LI63 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP20-1Q3LI63 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP20-1Q3LI63 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP20-1Q3LI63 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 138.4 ms