Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 TNFSF11-201ENST00000239849 911 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 ITGA9-AS1-205ENST00000438136 578 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 AC009119.2-201ENST00000561562 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 SNHG17-208ENST00000456953 546 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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