Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
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