Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CBFBQ13951 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CBFBQ13951 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CBFBQ13951 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CBFBQ13951 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CBFBQ13951 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CBFBQ13951 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CBFBQ13951 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CBFBQ13951 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CBFBQ13951 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CBFBQ13951 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CBFBQ13951 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CBFBQ13951 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CBFBQ13951 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CBFBQ13951 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CBFBQ13951 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CBFBQ13951 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CBFBQ13951 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CBFBQ13951 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CBFBQ13951 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CBFBQ13951 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CBFBQ13951 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CBFBQ13951 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CBFBQ13951 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CBFBQ13951 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CBFBQ13951 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CBFBQ13951 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CBFBQ13951 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CBFBQ13951 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CBFBQ13951 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CBFBQ13951 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CBFBQ13951 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CBFBQ13951 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CBFBQ13951 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CBFBQ13951 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CBFBQ13951 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CBFBQ13951 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CBFBQ13951 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CBFBQ13951 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CBFBQ13951 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CBFBQ13951 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CBFBQ13951 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CBFBQ13951 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CBFBQ13951 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CBFBQ13951 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CBFBQ13951 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CBFBQ13951 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CBFBQ13951 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CBFBQ13951 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CBFBQ13951 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CBFBQ13951 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CBFBQ13951 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CBFBQ13951 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CBFBQ13951 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CBFBQ13951 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CBFBQ13951 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CBFBQ13951 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CBFBQ13951 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CBFBQ13951 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CBFBQ13951 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CBFBQ13951 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CBFBQ13951 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CBFBQ13951 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CBFBQ13951 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CBFBQ13951 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CBFBQ13951 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CBFBQ13951 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CBFBQ13951 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CBFBQ13951 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CBFBQ13951 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CBFBQ13951 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CBFBQ13951 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CBFBQ13951 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CBFBQ13951 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CBFBQ13951 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CBFBQ13951 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CBFBQ13951 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CBFBQ13951 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CBFBQ13951 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CBFBQ13951 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CBFBQ13951 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CBFBQ13951 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CBFBQ13951 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CBFBQ13951 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CBFBQ13951 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CBFBQ13951 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CBFBQ13951 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CBFBQ13951 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CBFBQ13951 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CBFBQ13951 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CBFBQ13951 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CBFBQ13951 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CBFBQ13951 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CBFBQ13951 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CBFBQ13951 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CBFBQ13951 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CBFBQ13951 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CBFBQ13951 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CBFBQ13951 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CBFBQ13951 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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