Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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