Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEUROD1Q13562 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEUROD1Q13562 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEUROD1Q13562 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEUROD1Q13562 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEUROD1Q13562 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEUROD1Q13562 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEUROD1Q13562 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEUROD1Q13562 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEUROD1Q13562 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEUROD1Q13562 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
NEUROD1Q13562 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEUROD1Q13562 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEUROD1Q13562 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
NEUROD1Q13562 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEUROD1Q13562 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
NEUROD1Q13562 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEUROD1Q13562 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEUROD1Q13562 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEUROD1Q13562 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEUROD1Q13562 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
NEUROD1Q13562 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEUROD1Q13562 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEUROD1Q13562 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEUROD1Q13562 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
NEUROD1Q13562 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEUROD1Q13562 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEUROD1Q13562 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEUROD1Q13562 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEUROD1Q13562 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEUROD1Q13562 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEUROD1Q13562 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEUROD1Q13562 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEUROD1Q13562 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEUROD1Q13562 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEUROD1Q13562 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEUROD1Q13562 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEUROD1Q13562 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEUROD1Q13562 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEUROD1Q13562 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEUROD1Q13562 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEUROD1Q13562 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEUROD1Q13562 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEUROD1Q13562 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEUROD1Q13562 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEUROD1Q13562 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEUROD1Q13562 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEUROD1Q13562 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEUROD1Q13562 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEUROD1Q13562 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEUROD1Q13562 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEUROD1Q13562 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
NEUROD1Q13562 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
NEUROD1Q13562 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
NEUROD1Q13562 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEUROD1Q13562 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEUROD1Q13562 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEUROD1Q13562 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEUROD1Q13562 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEUROD1Q13562 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEUROD1Q13562 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEUROD1Q13562 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEUROD1Q13562 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEUROD1Q13562 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEUROD1Q13562 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEUROD1Q13562 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEUROD1Q13562 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEUROD1Q13562 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEUROD1Q13562 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEUROD1Q13562 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEUROD1Q13562 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEUROD1Q13562 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEUROD1Q13562 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEUROD1Q13562 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEUROD1Q13562 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEUROD1Q13562 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEUROD1Q13562 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEUROD1Q13562 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEUROD1Q13562 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEUROD1Q13562 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEUROD1Q13562 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEUROD1Q13562 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEUROD1Q13562 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEUROD1Q13562 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEUROD1Q13562 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
NEUROD1Q13562 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEUROD1Q13562 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
NEUROD1Q13562 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEUROD1Q13562 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
NEUROD1Q13562 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEUROD1Q13562 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEUROD1Q13562 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
NEUROD1Q13562 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEUROD1Q13562 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
NEUROD1Q13562 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEUROD1Q13562 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEUROD1Q13562 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEUROD1Q13562 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEUROD1Q13562 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEUROD1Q13562 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
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