Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 GABPB1-201ENST00000220429 2726 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 RPL15-213ENST00000611050 2363 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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