Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
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STRN3Q13033 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
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