Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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FOXD4Q12950 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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FOXD4Q12950 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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FOXD4Q12950 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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FOXD4Q12950 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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FOXD4Q12950 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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FOXD4Q12950 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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FOXD4Q12950 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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FOXD4Q12950 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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FOXD4Q12950 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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