Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 FAM192A-218ENST00000567439 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
PTPN13Q12923 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
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PTPN13Q12923 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
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PTPN13Q12923 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
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PTPN13Q12923 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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PTPN13Q12923 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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