Protein–RNA interactions for Protein: Q07343

PDE4B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4BQ07343 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDE4BQ07343 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDE4BQ07343 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDE4BQ07343 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDE4BQ07343 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDE4BQ07343 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDE4BQ07343 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDE4BQ07343 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDE4BQ07343 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDE4BQ07343 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDE4BQ07343 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDE4BQ07343 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDE4BQ07343 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDE4BQ07343 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDE4BQ07343 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDE4BQ07343 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDE4BQ07343 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDE4BQ07343 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDE4BQ07343 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDE4BQ07343 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDE4BQ07343 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDE4BQ07343 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDE4BQ07343 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDE4BQ07343 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDE4BQ07343 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDE4BQ07343 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDE4BQ07343 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDE4BQ07343 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDE4BQ07343 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDE4BQ07343 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDE4BQ07343 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDE4BQ07343 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDE4BQ07343 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDE4BQ07343 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDE4BQ07343 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDE4BQ07343 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDE4BQ07343 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDE4BQ07343 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDE4BQ07343 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDE4BQ07343 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDE4BQ07343 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDE4BQ07343 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDE4BQ07343 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDE4BQ07343 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDE4BQ07343 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDE4BQ07343 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDE4BQ07343 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDE4BQ07343 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDE4BQ07343 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDE4BQ07343 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PDE4BQ07343 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDE4BQ07343 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PDE4BQ07343 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDE4BQ07343 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDE4BQ07343 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDE4BQ07343 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDE4BQ07343 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDE4BQ07343 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDE4BQ07343 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDE4BQ07343 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDE4BQ07343 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDE4BQ07343 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDE4BQ07343 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDE4BQ07343 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDE4BQ07343 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDE4BQ07343 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDE4BQ07343 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDE4BQ07343 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDE4BQ07343 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDE4BQ07343 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDE4BQ07343 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDE4BQ07343 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDE4BQ07343 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDE4BQ07343 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDE4BQ07343 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDE4BQ07343 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDE4BQ07343 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDE4BQ07343 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDE4BQ07343 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDE4BQ07343 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDE4BQ07343 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDE4BQ07343 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDE4BQ07343 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDE4BQ07343 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDE4BQ07343 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDE4BQ07343 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDE4BQ07343 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDE4BQ07343 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDE4BQ07343 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDE4BQ07343 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDE4BQ07343 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PDE4BQ07343 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDE4BQ07343 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDE4BQ07343 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDE4BQ07343 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDE4BQ07343 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDE4BQ07343 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDE4BQ07343 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDE4BQ07343 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDE4BQ07343 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms