Protein–RNA interactions for Protein: Q05940

SLC18A2, Synaptic vesicular amine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A2Q05940 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms