Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms