Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
HBBP68871 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
HBBP68871 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
HBBP68871 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
HBBP68871 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
HBBP68871 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
HBBP68871 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
HBBP68871 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
HBBP68871 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
HBBP68871 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
HBBP68871 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
HBBP68871 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
HBBP68871 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
HBBP68871 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
HBBP68871 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
HBBP68871 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
HBBP68871 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
HBBP68871 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
HBBP68871 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
HBBP68871 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
HBBP68871 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
HBBP68871 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
HBBP68871 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
HBBP68871 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
HBBP68871 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
HBBP68871 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
HBBP68871 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
HBBP68871 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
HBBP68871 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
HBBP68871 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
HBBP68871 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
HBBP68871 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
HBBP68871 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
HBBP68871 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
HBBP68871 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
HBBP68871 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
HBBP68871 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
HBBP68871 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
HBBP68871 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC12□□□□□ -0.49
HBBP68871 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
HBBP68871 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
HBBP68871 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
HBBP68871 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
HBBP68871 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
HBBP68871 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
HBBP68871 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC12□□□□□ -0.49
HBBP68871 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
HBBP68871 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
HBBP68871 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
HBBP68871 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
HBBP68871 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
HBBP68871 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
HBBP68871 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC12□□□□□ -0.49
HBBP68871 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC12□□□□□ -0.49
HBBP68871 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
HBBP68871 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
HBBP68871 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
HBBP68871 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
HBBP68871 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
HBBP68871 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
HBBP68871 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
HBBP68871 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
HBBP68871 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
HBBP68871 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
HBBP68871 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
HBBP68871 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
HBBP68871 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
HBBP68871 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
HBBP68871 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
HBBP68871 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
HBBP68871 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
HBBP68871 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
HBBP68871 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
HBBP68871 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
HBBP68871 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
HBBP68871 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
HBBP68871 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
HBBP68871 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
HBBP68871 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
HBBP68871 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
HBBP68871 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
HBBP68871 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
HBBP68871 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
HBBP68871 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
HBBP68871 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
HBBP68871 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
HBBP68871 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
HBBP68871 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
HBBP68871 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
HBBP68871 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
HBBP68871 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
HBBP68871 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
HBBP68871 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
HBBP68871 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
HBBP68871 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
HBBP68871 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
HBBP68871 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
HBBP68871 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
HBBP68871 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
HBBP68871 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms