Protein–RNA interactions for Protein: P60508

ERVFRD-1, Syncytin-2, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFRD-1P60508 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms