Protein–RNA interactions for Protein: P55327

TPD52, Tumor protein D52, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPD52P55327 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TPD52P55327 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TPD52P55327 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TPD52P55327 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TPD52P55327 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TPD52P55327 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TPD52P55327 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TPD52P55327 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TPD52P55327 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TPD52P55327 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TPD52P55327 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TPD52P55327 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TPD52P55327 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TPD52P55327 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TPD52P55327 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TPD52P55327 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TPD52P55327 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TPD52P55327 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TPD52P55327 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TPD52P55327 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TPD52P55327 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TPD52P55327 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TPD52P55327 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TPD52P55327 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TPD52P55327 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TPD52P55327 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TPD52P55327 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TPD52P55327 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TPD52P55327 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TPD52P55327 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TPD52P55327 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TPD52P55327 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TPD52P55327 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TPD52P55327 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TPD52P55327 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TPD52P55327 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TPD52P55327 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TPD52P55327 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TPD52P55327 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TPD52P55327 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TPD52P55327 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TPD52P55327 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TPD52P55327 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TPD52P55327 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TPD52P55327 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TPD52P55327 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TPD52P55327 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TPD52P55327 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TPD52P55327 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TPD52P55327 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TPD52P55327 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TPD52P55327 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TPD52P55327 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TPD52P55327 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TPD52P55327 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TPD52P55327 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TPD52P55327 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TPD52P55327 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TPD52P55327 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TPD52P55327 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TPD52P55327 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TPD52P55327 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TPD52P55327 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TPD52P55327 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TPD52P55327 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TPD52P55327 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TPD52P55327 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TPD52P55327 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TPD52P55327 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TPD52P55327 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TPD52P55327 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TPD52P55327 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TPD52P55327 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TPD52P55327 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TPD52P55327 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TPD52P55327 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TPD52P55327 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TPD52P55327 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TPD52P55327 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TPD52P55327 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TPD52P55327 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TPD52P55327 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TPD52P55327 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TPD52P55327 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TPD52P55327 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TPD52P55327 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TPD52P55327 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TPD52P55327 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TPD52P55327 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TPD52P55327 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TPD52P55327 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TPD52P55327 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TPD52P55327 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TPD52P55327 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TPD52P55327 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TPD52P55327 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TPD52P55327 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TPD52P55327 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TPD52P55327 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TPD52P55327 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms