Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
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PGGT1BP53609 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PGGT1BP53609 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PGGT1BP53609 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PGGT1BP53609 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PGGT1BP53609 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PGGT1BP53609 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PGGT1BP53609 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PGGT1BP53609 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PGGT1BP53609 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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PGGT1BP53609 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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PGGT1BP53609 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
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PGGT1BP53609 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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PGGT1BP53609 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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PGGT1BP53609 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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PGGT1BP53609 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PGGT1BP53609 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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PGGT1BP53609 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PGGT1BP53609 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PGGT1BP53609 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PGGT1BP53609 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PGGT1BP53609 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PGGT1BP53609 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PGGT1BP53609 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PGGT1BP53609 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PGGT1BP53609 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PGGT1BP53609 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PGGT1BP53609 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PGGT1BP53609 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
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