Protein–RNA interactions for Protein: P48995

TRPC1, Short transient receptor potential channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1P48995 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 HNF1B-204ENST00000617811 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms