Protein–RNA interactions for Protein: P47870

GABRB2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB2P47870 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABRB2P47870 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABRB2P47870 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABRB2P47870 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABRB2P47870 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABRB2P47870 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABRB2P47870 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABRB2P47870 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABRB2P47870 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABRB2P47870 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABRB2P47870 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABRB2P47870 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABRB2P47870 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABRB2P47870 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABRB2P47870 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABRB2P47870 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABRB2P47870 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABRB2P47870 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABRB2P47870 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABRB2P47870 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
GABRB2P47870 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABRB2P47870 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABRB2P47870 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABRB2P47870 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABRB2P47870 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABRB2P47870 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABRB2P47870 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GABRB2P47870 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GABRB2P47870 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GABRB2P47870 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GABRB2P47870 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GABRB2P47870 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GABRB2P47870 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GABRB2P47870 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GABRB2P47870 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GABRB2P47870 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABRB2P47870 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABRB2P47870 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GABRB2P47870 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABRB2P47870 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABRB2P47870 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABRB2P47870 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABRB2P47870 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABRB2P47870 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABRB2P47870 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABRB2P47870 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABRB2P47870 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABRB2P47870 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABRB2P47870 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABRB2P47870 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABRB2P47870 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABRB2P47870 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GABRB2P47870 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABRB2P47870 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABRB2P47870 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GABRB2P47870 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABRB2P47870 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABRB2P47870 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABRB2P47870 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABRB2P47870 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABRB2P47870 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABRB2P47870 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABRB2P47870 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GABRB2P47870 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABRB2P47870 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABRB2P47870 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABRB2P47870 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABRB2P47870 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABRB2P47870 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABRB2P47870 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABRB2P47870 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABRB2P47870 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABRB2P47870 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABRB2P47870 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABRB2P47870 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABRB2P47870 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABRB2P47870 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABRB2P47870 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABRB2P47870 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABRB2P47870 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABRB2P47870 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABRB2P47870 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABRB2P47870 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABRB2P47870 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABRB2P47870 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABRB2P47870 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABRB2P47870 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABRB2P47870 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABRB2P47870 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABRB2P47870 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABRB2P47870 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABRB2P47870 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABRB2P47870 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABRB2P47870 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABRB2P47870 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABRB2P47870 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABRB2P47870 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABRB2P47870 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABRB2P47870 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABRB2P47870 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms