Protein–RNA interactions for Protein: P43115

PTGER3, Prostaglandin E2 receptor EP3 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER3P43115 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTGER3P43115 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTGER3P43115 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTGER3P43115 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTGER3P43115 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTGER3P43115 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTGER3P43115 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTGER3P43115 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTGER3P43115 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTGER3P43115 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTGER3P43115 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTGER3P43115 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTGER3P43115 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTGER3P43115 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTGER3P43115 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTGER3P43115 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTGER3P43115 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTGER3P43115 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTGER3P43115 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PTGER3P43115 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTGER3P43115 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTGER3P43115 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTGER3P43115 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTGER3P43115 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTGER3P43115 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTGER3P43115 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTGER3P43115 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTGER3P43115 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTGER3P43115 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTGER3P43115 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTGER3P43115 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PTGER3P43115 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
PTGER3P43115 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PTGER3P43115 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PTGER3P43115 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PTGER3P43115 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PTGER3P43115 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PTGER3P43115 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PTGER3P43115 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PTGER3P43115 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PTGER3P43115 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PTGER3P43115 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PTGER3P43115 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTGER3P43115 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTGER3P43115 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTGER3P43115 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTGER3P43115 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTGER3P43115 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTGER3P43115 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTGER3P43115 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTGER3P43115 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTGER3P43115 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTGER3P43115 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTGER3P43115 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTGER3P43115 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTGER3P43115 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTGER3P43115 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTGER3P43115 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTGER3P43115 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTGER3P43115 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTGER3P43115 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTGER3P43115 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTGER3P43115 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PTGER3P43115 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTGER3P43115 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTGER3P43115 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTGER3P43115 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTGER3P43115 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTGER3P43115 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTGER3P43115 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PTGER3P43115 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTGER3P43115 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTGER3P43115 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTGER3P43115 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTGER3P43115 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTGER3P43115 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PTGER3P43115 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTGER3P43115 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTGER3P43115 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTGER3P43115 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTGER3P43115 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTGER3P43115 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTGER3P43115 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTGER3P43115 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTGER3P43115 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTGER3P43115 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTGER3P43115 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTGER3P43115 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTGER3P43115 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTGER3P43115 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTGER3P43115 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTGER3P43115 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTGER3P43115 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTGER3P43115 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTGER3P43115 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTGER3P43115 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTGER3P43115 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTGER3P43115 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PTGER3P43115 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTGER3P43115 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms