Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TMPOP42166 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TMPOP42166 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TMPOP42166 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TMPOP42166 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMPOP42166 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMPOP42166 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMPOP42166 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMPOP42166 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMPOP42166 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMPOP42166 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMPOP42166 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMPOP42166 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMPOP42166 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMPOP42166 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMPOP42166 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMPOP42166 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMPOP42166 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMPOP42166 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMPOP42166 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMPOP42166 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMPOP42166 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMPOP42166 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMPOP42166 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMPOP42166 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMPOP42166 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMPOP42166 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMPOP42166 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMPOP42166 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMPOP42166 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMPOP42166 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMPOP42166 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMPOP42166 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMPOP42166 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMPOP42166 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMPOP42166 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMPOP42166 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMPOP42166 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMPOP42166 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMPOP42166 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMPOP42166 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMPOP42166 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMPOP42166 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMPOP42166 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
TMPOP42166 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMPOP42166 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMPOP42166 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMPOP42166 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMPOP42166 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMPOP42166 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMPOP42166 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMPOP42166 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
TMPOP42166 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMPOP42166 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMPOP42166 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMPOP42166 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMPOP42166 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
TMPOP42166 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMPOP42166 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMPOP42166 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMPOP42166 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMPOP42166 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMPOP42166 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMPOP42166 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMPOP42166 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMPOP42166 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMPOP42166 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMPOP42166 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMPOP42166 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMPOP42166 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMPOP42166 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMPOP42166 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMPOP42166 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMPOP42166 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMPOP42166 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMPOP42166 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMPOP42166 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMPOP42166 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMPOP42166 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMPOP42166 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMPOP42166 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMPOP42166 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMPOP42166 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMPOP42166 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMPOP42166 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
TMPOP42166 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMPOP42166 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMPOP42166 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
TMPOP42166 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
TMPOP42166 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
TMPOP42166 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMPOP42166 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMPOP42166 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
TMPOP42166 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
TMPOP42166 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
TMPOP42166 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMPOP42166 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMPOP42166 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMPOP42166 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMPOP42166 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms