Protein–RNA interactions for Protein: P29508

SERPINB3, Serpin B3, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINB3P29508 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SERPINB3P29508 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SERPINB3P29508 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SERPINB3P29508 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SERPINB3P29508 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SERPINB3P29508 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SERPINB3P29508 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SERPINB3P29508 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SERPINB3P29508 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SERPINB3P29508 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SERPINB3P29508 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SERPINB3P29508 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SERPINB3P29508 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SERPINB3P29508 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SERPINB3P29508 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SERPINB3P29508 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SERPINB3P29508 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SERPINB3P29508 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SERPINB3P29508 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SERPINB3P29508 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SERPINB3P29508 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SERPINB3P29508 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SERPINB3P29508 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SERPINB3P29508 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SERPINB3P29508 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SERPINB3P29508 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SERPINB3P29508 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SERPINB3P29508 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SERPINB3P29508 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SERPINB3P29508 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SERPINB3P29508 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SERPINB3P29508 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SERPINB3P29508 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SERPINB3P29508 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SERPINB3P29508 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SERPINB3P29508 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SERPINB3P29508 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SERPINB3P29508 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SERPINB3P29508 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SERPINB3P29508 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SERPINB3P29508 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SERPINB3P29508 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SERPINB3P29508 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SERPINB3P29508 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SERPINB3P29508 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SERPINB3P29508 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SERPINB3P29508 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SERPINB3P29508 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SERPINB3P29508 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SERPINB3P29508 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SERPINB3P29508 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SERPINB3P29508 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SERPINB3P29508 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SERPINB3P29508 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SERPINB3P29508 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SERPINB3P29508 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SERPINB3P29508 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SERPINB3P29508 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SERPINB3P29508 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SERPINB3P29508 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SERPINB3P29508 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SERPINB3P29508 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SERPINB3P29508 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SERPINB3P29508 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SERPINB3P29508 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SERPINB3P29508 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SERPINB3P29508 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SERPINB3P29508 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SERPINB3P29508 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SERPINB3P29508 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SERPINB3P29508 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SERPINB3P29508 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SERPINB3P29508 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SERPINB3P29508 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SERPINB3P29508 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SERPINB3P29508 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SERPINB3P29508 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SERPINB3P29508 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SERPINB3P29508 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SERPINB3P29508 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SERPINB3P29508 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SERPINB3P29508 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SERPINB3P29508 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SERPINB3P29508 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SERPINB3P29508 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SERPINB3P29508 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SERPINB3P29508 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SERPINB3P29508 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SERPINB3P29508 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SERPINB3P29508 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SERPINB3P29508 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SERPINB3P29508 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SERPINB3P29508 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SERPINB3P29508 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SERPINB3P29508 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SERPINB3P29508 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SERPINB3P29508 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SERPINB3P29508 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SERPINB3P29508 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SERPINB3P29508 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms