Protein–RNA interactions for Protein: P26232

CTNNA2, Catenin alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA2P26232 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTNNA2P26232 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CTNNA2P26232 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTNNA2P26232 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTNNA2P26232 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTNNA2P26232 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTNNA2P26232 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CTNNA2P26232 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CTNNA2P26232 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CTNNA2P26232 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CTNNA2P26232 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CTNNA2P26232 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CTNNA2P26232 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CTNNA2P26232 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
CTNNA2P26232 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CTNNA2P26232 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTNNA2P26232 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTNNA2P26232 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTNNA2P26232 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTNNA2P26232 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTNNA2P26232 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTNNA2P26232 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CTNNA2P26232 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CTNNA2P26232 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTNNA2P26232 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTNNA2P26232 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTNNA2P26232 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTNNA2P26232 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTNNA2P26232 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTNNA2P26232 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTNNA2P26232 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTNNA2P26232 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTNNA2P26232 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTNNA2P26232 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTNNA2P26232 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTNNA2P26232 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTNNA2P26232 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CTNNA2P26232 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CTNNA2P26232 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTNNA2P26232 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTNNA2P26232 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTNNA2P26232 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTNNA2P26232 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTNNA2P26232 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTNNA2P26232 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTNNA2P26232 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTNNA2P26232 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTNNA2P26232 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTNNA2P26232 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTNNA2P26232 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTNNA2P26232 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTNNA2P26232 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTNNA2P26232 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTNNA2P26232 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTNNA2P26232 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTNNA2P26232 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTNNA2P26232 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTNNA2P26232 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTNNA2P26232 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTNNA2P26232 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTNNA2P26232 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTNNA2P26232 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTNNA2P26232 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTNNA2P26232 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTNNA2P26232 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTNNA2P26232 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTNNA2P26232 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTNNA2P26232 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTNNA2P26232 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTNNA2P26232 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTNNA2P26232 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTNNA2P26232 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTNNA2P26232 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CTNNA2P26232 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTNNA2P26232 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTNNA2P26232 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTNNA2P26232 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTNNA2P26232 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTNNA2P26232 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTNNA2P26232 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTNNA2P26232 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTNNA2P26232 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CTNNA2P26232 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTNNA2P26232 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTNNA2P26232 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTNNA2P26232 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CTNNA2P26232 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTNNA2P26232 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTNNA2P26232 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTNNA2P26232 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTNNA2P26232 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTNNA2P26232 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTNNA2P26232 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTNNA2P26232 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTNNA2P26232 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTNNA2P26232 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTNNA2P26232 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTNNA2P26232 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTNNA2P26232 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTNNA2P26232 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms