Protein–RNA interactions for Protein: P23610

F8A1, Factor VIII intron 22 protein, humanhuman

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8A1P23610 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
F8A1P23610 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
F8A1P23610 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
F8A1P23610 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
F8A1P23610 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
F8A1P23610 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
F8A1P23610 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
F8A1P23610 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
F8A1P23610 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
F8A1P23610 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
F8A1P23610 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
F8A1P23610 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
F8A1P23610 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
F8A1P23610 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
F8A1P23610 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
F8A1P23610 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
F8A1P23610 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
F8A1P23610 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
F8A1P23610 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
F8A1P23610 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
F8A1P23610 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
F8A1P23610 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
F8A1P23610 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
F8A1P23610 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
F8A1P23610 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
F8A1P23610 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
F8A1P23610 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
F8A1P23610 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
F8A1P23610 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
F8A1P23610 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
F8A1P23610 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
F8A1P23610 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
F8A1P23610 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
F8A1P23610 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
F8A1P23610 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
F8A1P23610 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
F8A1P23610 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
F8A1P23610 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
F8A1P23610 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
F8A1P23610 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
F8A1P23610 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
F8A1P23610 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
F8A1P23610 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
F8A1P23610 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
F8A1P23610 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
F8A1P23610 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
F8A1P23610 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
F8A1P23610 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
F8A1P23610 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
F8A1P23610 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
F8A1P23610 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
F8A1P23610 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
F8A1P23610 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
F8A1P23610 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
F8A1P23610 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
F8A1P23610 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
F8A1P23610 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
F8A1P23610 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
F8A1P23610 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
F8A1P23610 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
F8A1P23610 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
F8A1P23610 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
F8A1P23610 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
F8A1P23610 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
F8A1P23610 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
F8A1P23610 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
F8A1P23610 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
F8A1P23610 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
F8A1P23610 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
F8A1P23610 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
F8A1P23610 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
F8A1P23610 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
F8A1P23610 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
F8A1P23610 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
F8A1P23610 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
F8A1P23610 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
F8A1P23610 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
F8A1P23610 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
F8A1P23610 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
F8A1P23610 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
F8A1P23610 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
F8A1P23610 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
F8A1P23610 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
F8A1P23610 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
F8A1P23610 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
F8A1P23610 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
F8A1P23610 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
F8A1P23610 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
F8A1P23610 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
F8A1P23610 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
F8A1P23610 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
F8A1P23610 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
F8A1P23610 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
F8A1P23610 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
F8A1P23610 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
F8A1P23610 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
F8A1P23610 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
F8A1P23610 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
F8A1P23610 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
F8A1P23610 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms