Protein–RNA interactions for Protein: P23219

PTGS1, Prostaglandin G/H synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGS1P23219 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTGS1P23219 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTGS1P23219 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTGS1P23219 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTGS1P23219 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PTGS1P23219 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTGS1P23219 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTGS1P23219 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTGS1P23219 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTGS1P23219 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PTGS1P23219 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTGS1P23219 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTGS1P23219 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTGS1P23219 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTGS1P23219 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTGS1P23219 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTGS1P23219 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTGS1P23219 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTGS1P23219 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTGS1P23219 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PTGS1P23219 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTGS1P23219 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PTGS1P23219 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTGS1P23219 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTGS1P23219 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTGS1P23219 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTGS1P23219 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTGS1P23219 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTGS1P23219 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTGS1P23219 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTGS1P23219 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTGS1P23219 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTGS1P23219 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTGS1P23219 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTGS1P23219 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTGS1P23219 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTGS1P23219 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTGS1P23219 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTGS1P23219 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTGS1P23219 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTGS1P23219 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTGS1P23219 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PTGS1P23219 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PTGS1P23219 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTGS1P23219 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTGS1P23219 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTGS1P23219 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PTGS1P23219 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PTGS1P23219 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTGS1P23219 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTGS1P23219 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTGS1P23219 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTGS1P23219 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTGS1P23219 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTGS1P23219 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PTGS1P23219 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTGS1P23219 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTGS1P23219 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTGS1P23219 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTGS1P23219 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTGS1P23219 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTGS1P23219 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTGS1P23219 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTGS1P23219 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTGS1P23219 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTGS1P23219 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTGS1P23219 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTGS1P23219 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTGS1P23219 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTGS1P23219 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTGS1P23219 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTGS1P23219 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTGS1P23219 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTGS1P23219 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTGS1P23219 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTGS1P23219 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTGS1P23219 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTGS1P23219 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTGS1P23219 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PTGS1P23219 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTGS1P23219 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTGS1P23219 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTGS1P23219 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTGS1P23219 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTGS1P23219 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTGS1P23219 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTGS1P23219 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTGS1P23219 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTGS1P23219 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTGS1P23219 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTGS1P23219 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTGS1P23219 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTGS1P23219 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTGS1P23219 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PTGS1P23219 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTGS1P23219 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTGS1P23219 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTGS1P23219 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTGS1P23219 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTGS1P23219 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms