Protein–RNA interactions for Protein: P20936

RASA1, Ras GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASA1P20936 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
RASA1P20936 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RASA1P20936 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RASA1P20936 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RASA1P20936 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RASA1P20936 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RASA1P20936 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RASA1P20936 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RASA1P20936 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RASA1P20936 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RASA1P20936 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RASA1P20936 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RASA1P20936 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RASA1P20936 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RASA1P20936 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RASA1P20936 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RASA1P20936 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RASA1P20936 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RASA1P20936 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RASA1P20936 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RASA1P20936 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RASA1P20936 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RASA1P20936 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RASA1P20936 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RASA1P20936 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
RASA1P20936 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RASA1P20936 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RASA1P20936 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RASA1P20936 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RASA1P20936 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RASA1P20936 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RASA1P20936 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RASA1P20936 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RASA1P20936 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RASA1P20936 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RASA1P20936 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RASA1P20936 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RASA1P20936 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RASA1P20936 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RASA1P20936 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RASA1P20936 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RASA1P20936 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RASA1P20936 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RASA1P20936 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RASA1P20936 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RASA1P20936 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RASA1P20936 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RASA1P20936 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RASA1P20936 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RASA1P20936 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RASA1P20936 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RASA1P20936 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RASA1P20936 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RASA1P20936 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RASA1P20936 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
RASA1P20936 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RASA1P20936 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RASA1P20936 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RASA1P20936 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RASA1P20936 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
RASA1P20936 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RASA1P20936 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RASA1P20936 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RASA1P20936 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RASA1P20936 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
RASA1P20936 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RASA1P20936 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RASA1P20936 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RASA1P20936 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RASA1P20936 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RASA1P20936 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RASA1P20936 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RASA1P20936 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RASA1P20936 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RASA1P20936 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RASA1P20936 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RASA1P20936 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RASA1P20936 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RASA1P20936 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RASA1P20936 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RASA1P20936 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RASA1P20936 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RASA1P20936 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RASA1P20936 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RASA1P20936 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RASA1P20936 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RASA1P20936 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RASA1P20936 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RASA1P20936 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RASA1P20936 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
RASA1P20936 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RASA1P20936 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RASA1P20936 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RASA1P20936 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RASA1P20936 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
RASA1P20936 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RASA1P20936 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RASA1P20936 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RASA1P20936 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RASA1P20936 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms