Protein–RNA interactions for Protein: P20036

HLA-DPA1, HLA class II histocompatibility antigen, DP alpha 1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DPA1P20036 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HLA-DPA1P20036 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
HLA-DPA1P20036 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
HLA-DPA1P20036 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HLA-DPA1P20036 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
HLA-DPA1P20036 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HLA-DPA1P20036 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HLA-DPA1P20036 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HLA-DPA1P20036 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HLA-DPA1P20036 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HLA-DPA1P20036 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HLA-DPA1P20036 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HLA-DPA1P20036 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HLA-DPA1P20036 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HLA-DPA1P20036 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HLA-DPA1P20036 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HLA-DPA1P20036 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HLA-DPA1P20036 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
HLA-DPA1P20036 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HLA-DPA1P20036 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HLA-DPA1P20036 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HLA-DPA1P20036 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HLA-DPA1P20036 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HLA-DPA1P20036 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HLA-DPA1P20036 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HLA-DPA1P20036 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HLA-DPA1P20036 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HLA-DPA1P20036 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HLA-DPA1P20036 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HLA-DPA1P20036 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HLA-DPA1P20036 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HLA-DPA1P20036 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HLA-DPA1P20036 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HLA-DPA1P20036 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HLA-DPA1P20036 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HLA-DPA1P20036 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HLA-DPA1P20036 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HLA-DPA1P20036 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HLA-DPA1P20036 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HLA-DPA1P20036 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HLA-DPA1P20036 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HLA-DPA1P20036 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HLA-DPA1P20036 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HLA-DPA1P20036 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HLA-DPA1P20036 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HLA-DPA1P20036 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HLA-DPA1P20036 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HLA-DPA1P20036 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-DPA1P20036 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-DPA1P20036 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-DPA1P20036 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-DPA1P20036 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-DPA1P20036 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-DPA1P20036 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-DPA1P20036 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-DPA1P20036 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-DPA1P20036 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-DPA1P20036 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-DPA1P20036 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-DPA1P20036 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-DPA1P20036 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-DPA1P20036 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-DPA1P20036 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-DPA1P20036 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-DPA1P20036 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-DPA1P20036 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-DPA1P20036 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-DPA1P20036 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-DPA1P20036 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-DPA1P20036 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-DPA1P20036 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-DPA1P20036 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-DPA1P20036 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-DPA1P20036 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-DPA1P20036 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-DPA1P20036 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-DPA1P20036 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-DPA1P20036 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-DPA1P20036 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-DPA1P20036 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-DPA1P20036 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-DPA1P20036 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-DPA1P20036 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-DPA1P20036 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-DPA1P20036 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-DPA1P20036 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-DPA1P20036 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-DPA1P20036 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-DPA1P20036 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-DPA1P20036 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HLA-DPA1P20036 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HLA-DPA1P20036 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HLA-DPA1P20036 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HLA-DPA1P20036 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HLA-DPA1P20036 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HLA-DPA1P20036 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HLA-DPA1P20036 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HLA-DPA1P20036 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HLA-DPA1P20036 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HLA-DPA1P20036 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms