Protein–RNA interactions for Protein: P17812

CTPS1, CTP synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1P17812 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.5 ms