Protein–RNA interactions for Protein: P17538

CTRB1, Chymotrypsinogen B, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTRB1P17538 C12orf43-202ENST00000445832 2397 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 CYB561-202ENST00000392975 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 USH1G-202ENST00000614341 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 C5AR1-201ENST00000355085 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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