Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CREB1P16220 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CREB1P16220 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CREB1P16220 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CREB1P16220 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CREB1P16220 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CREB1P16220 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CREB1P16220 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CREB1P16220 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CREB1P16220 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CREB1P16220 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CREB1P16220 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CREB1P16220 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CREB1P16220 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CREB1P16220 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CREB1P16220 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CREB1P16220 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CREB1P16220 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CREB1P16220 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CREB1P16220 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CREB1P16220 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CREB1P16220 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CREB1P16220 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CREB1P16220 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CREB1P16220 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CREB1P16220 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CREB1P16220 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CREB1P16220 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CREB1P16220 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CREB1P16220 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CREB1P16220 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CREB1P16220 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CREB1P16220 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CREB1P16220 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CREB1P16220 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CREB1P16220 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CREB1P16220 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CREB1P16220 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CREB1P16220 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CREB1P16220 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CREB1P16220 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CREB1P16220 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CREB1P16220 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CREB1P16220 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CREB1P16220 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CREB1P16220 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CREB1P16220 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CREB1P16220 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CREB1P16220 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CREB1P16220 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CREB1P16220 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CREB1P16220 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CREB1P16220 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CREB1P16220 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CREB1P16220 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CREB1P16220 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CREB1P16220 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CREB1P16220 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CREB1P16220 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CREB1P16220 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CREB1P16220 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CREB1P16220 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CREB1P16220 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CREB1P16220 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CREB1P16220 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CREB1P16220 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CREB1P16220 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CREB1P16220 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CREB1P16220 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CREB1P16220 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CREB1P16220 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CREB1P16220 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CREB1P16220 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CREB1P16220 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CREB1P16220 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CREB1P16220 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CREB1P16220 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CREB1P16220 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CREB1P16220 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CREB1P16220 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CREB1P16220 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CREB1P16220 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CREB1P16220 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CREB1P16220 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CREB1P16220 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CREB1P16220 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CREB1P16220 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CREB1P16220 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CREB1P16220 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CREB1P16220 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CREB1P16220 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CREB1P16220 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CREB1P16220 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CREB1P16220 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CREB1P16220 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CREB1P16220 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CREB1P16220 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CREB1P16220 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CREB1P16220 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CREB1P16220 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms