Protein–RNA interactions for Protein: P10826

RARB, Retinoic acid receptor beta, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARBP10826 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RARBP10826 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RARBP10826 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RARBP10826 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RARBP10826 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RARBP10826 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RARBP10826 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RARBP10826 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RARBP10826 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RARBP10826 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RARBP10826 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RARBP10826 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RARBP10826 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RARBP10826 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RARBP10826 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RARBP10826 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RARBP10826 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RARBP10826 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RARBP10826 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RARBP10826 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RARBP10826 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RARBP10826 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RARBP10826 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RARBP10826 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RARBP10826 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RARBP10826 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RARBP10826 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RARBP10826 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RARBP10826 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RARBP10826 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RARBP10826 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RARBP10826 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RARBP10826 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RARBP10826 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RARBP10826 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RARBP10826 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RARBP10826 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RARBP10826 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RARBP10826 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RARBP10826 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RARBP10826 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RARBP10826 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RARBP10826 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RARBP10826 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RARBP10826 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RARBP10826 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RARBP10826 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RARBP10826 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RARBP10826 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RARBP10826 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RARBP10826 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RARBP10826 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RARBP10826 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RARBP10826 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RARBP10826 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RARBP10826 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RARBP10826 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RARBP10826 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RARBP10826 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RARBP10826 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RARBP10826 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RARBP10826 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RARBP10826 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RARBP10826 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RARBP10826 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RARBP10826 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RARBP10826 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RARBP10826 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RARBP10826 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RARBP10826 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RARBP10826 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RARBP10826 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RARBP10826 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RARBP10826 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RARBP10826 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RARBP10826 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RARBP10826 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RARBP10826 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RARBP10826 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RARBP10826 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RARBP10826 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RARBP10826 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RARBP10826 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RARBP10826 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RARBP10826 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RARBP10826 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RARBP10826 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RARBP10826 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RARBP10826 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RARBP10826 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RARBP10826 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RARBP10826 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RARBP10826 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RARBP10826 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RARBP10826 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RARBP10826 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
RARBP10826 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RARBP10826 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RARBP10826 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RARBP10826 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms