Protein–RNA interactions for Protein: P0DO97

CCDC192, Coiled-coil domain-containing protein 192, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC192P0DO97 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC192P0DO97 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC192P0DO97 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC192P0DO97 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC192P0DO97 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC192P0DO97 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms