Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms