Protein–RNA interactions for Protein: O95741

CPNE6, Copine-6, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE6O95741 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CPNE6O95741 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CPNE6O95741 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CPNE6O95741 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CPNE6O95741 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CPNE6O95741 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CPNE6O95741 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CPNE6O95741 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CPNE6O95741 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CPNE6O95741 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CPNE6O95741 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CPNE6O95741 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CPNE6O95741 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CPNE6O95741 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CPNE6O95741 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CPNE6O95741 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CPNE6O95741 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CPNE6O95741 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CPNE6O95741 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CPNE6O95741 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CPNE6O95741 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CPNE6O95741 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CPNE6O95741 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CPNE6O95741 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CPNE6O95741 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CPNE6O95741 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CPNE6O95741 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CPNE6O95741 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CPNE6O95741 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CPNE6O95741 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CPNE6O95741 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CPNE6O95741 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CPNE6O95741 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CPNE6O95741 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CPNE6O95741 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CPNE6O95741 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CPNE6O95741 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CPNE6O95741 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CPNE6O95741 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CPNE6O95741 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CPNE6O95741 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CPNE6O95741 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CPNE6O95741 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CPNE6O95741 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CPNE6O95741 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CPNE6O95741 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CPNE6O95741 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CPNE6O95741 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CPNE6O95741 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CPNE6O95741 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CPNE6O95741 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CPNE6O95741 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CPNE6O95741 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CPNE6O95741 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CPNE6O95741 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CPNE6O95741 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CPNE6O95741 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CPNE6O95741 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CPNE6O95741 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CPNE6O95741 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CPNE6O95741 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CPNE6O95741 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CPNE6O95741 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CPNE6O95741 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CPNE6O95741 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CPNE6O95741 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CPNE6O95741 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CPNE6O95741 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CPNE6O95741 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CPNE6O95741 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CPNE6O95741 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CPNE6O95741 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CPNE6O95741 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CPNE6O95741 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CPNE6O95741 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CPNE6O95741 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CPNE6O95741 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CPNE6O95741 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CPNE6O95741 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CPNE6O95741 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CPNE6O95741 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CPNE6O95741 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CPNE6O95741 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CPNE6O95741 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CPNE6O95741 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CPNE6O95741 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CPNE6O95741 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CPNE6O95741 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CPNE6O95741 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CPNE6O95741 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CPNE6O95741 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CPNE6O95741 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CPNE6O95741 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CPNE6O95741 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CPNE6O95741 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CPNE6O95741 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CPNE6O95741 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CPNE6O95741 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CPNE6O95741 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CPNE6O95741 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms