Protein–RNA interactions for Protein: O95707

POP4, Ribonuclease P protein subunit p29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP4O95707 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
POP4O95707 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
POP4O95707 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
POP4O95707 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
POP4O95707 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
POP4O95707 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
POP4O95707 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POP4O95707 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
POP4O95707 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POP4O95707 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POP4O95707 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POP4O95707 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POP4O95707 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POP4O95707 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
POP4O95707 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
POP4O95707 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
POP4O95707 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POP4O95707 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POP4O95707 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POP4O95707 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POP4O95707 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
POP4O95707 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
POP4O95707 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POP4O95707 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POP4O95707 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POP4O95707 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
POP4O95707 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POP4O95707 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
POP4O95707 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
POP4O95707 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POP4O95707 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
POP4O95707 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POP4O95707 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POP4O95707 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POP4O95707 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POP4O95707 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
POP4O95707 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
POP4O95707 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POP4O95707 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POP4O95707 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POP4O95707 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POP4O95707 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POP4O95707 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POP4O95707 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POP4O95707 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POP4O95707 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POP4O95707 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POP4O95707 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POP4O95707 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POP4O95707 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POP4O95707 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POP4O95707 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POP4O95707 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POP4O95707 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POP4O95707 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POP4O95707 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
POP4O95707 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POP4O95707 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
POP4O95707 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POP4O95707 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POP4O95707 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POP4O95707 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POP4O95707 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POP4O95707 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POP4O95707 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
POP4O95707 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POP4O95707 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POP4O95707 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POP4O95707 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POP4O95707 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POP4O95707 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POP4O95707 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POP4O95707 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POP4O95707 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POP4O95707 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POP4O95707 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POP4O95707 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POP4O95707 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POP4O95707 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POP4O95707 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POP4O95707 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POP4O95707 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POP4O95707 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POP4O95707 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POP4O95707 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POP4O95707 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POP4O95707 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POP4O95707 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POP4O95707 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POP4O95707 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POP4O95707 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POP4O95707 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POP4O95707 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POP4O95707 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
POP4O95707 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POP4O95707 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POP4O95707 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POP4O95707 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POP4O95707 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POP4O95707 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms