Protein–RNA interactions for Protein: O43586

PSTPIP1, Proline-serine-threonine phosphatase-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSTPIP1O43586 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSTPIP1O43586 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSTPIP1O43586 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSTPIP1O43586 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSTPIP1O43586 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSTPIP1O43586 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSTPIP1O43586 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSTPIP1O43586 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSTPIP1O43586 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSTPIP1O43586 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSTPIP1O43586 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSTPIP1O43586 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSTPIP1O43586 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSTPIP1O43586 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSTPIP1O43586 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSTPIP1O43586 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSTPIP1O43586 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSTPIP1O43586 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSTPIP1O43586 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSTPIP1O43586 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSTPIP1O43586 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSTPIP1O43586 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSTPIP1O43586 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSTPIP1O43586 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSTPIP1O43586 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PSTPIP1O43586 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PSTPIP1O43586 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PSTPIP1O43586 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSTPIP1O43586 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSTPIP1O43586 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PSTPIP1O43586 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PSTPIP1O43586 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PSTPIP1O43586 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PSTPIP1O43586 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PSTPIP1O43586 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PSTPIP1O43586 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSTPIP1O43586 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSTPIP1O43586 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSTPIP1O43586 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSTPIP1O43586 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSTPIP1O43586 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSTPIP1O43586 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSTPIP1O43586 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSTPIP1O43586 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSTPIP1O43586 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSTPIP1O43586 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSTPIP1O43586 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PSTPIP1O43586 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
PSTPIP1O43586 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
PSTPIP1O43586 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PSTPIP1O43586 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
PSTPIP1O43586 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PSTPIP1O43586 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.26
PSTPIP1O43586 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PSTPIP1O43586 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
PSTPIP1O43586 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSTPIP1O43586 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSTPIP1O43586 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSTPIP1O43586 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSTPIP1O43586 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSTPIP1O43586 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSTPIP1O43586 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PSTPIP1O43586 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSTPIP1O43586 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSTPIP1O43586 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSTPIP1O43586 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSTPIP1O43586 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSTPIP1O43586 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSTPIP1O43586 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSTPIP1O43586 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSTPIP1O43586 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSTPIP1O43586 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSTPIP1O43586 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSTPIP1O43586 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSTPIP1O43586 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSTPIP1O43586 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSTPIP1O43586 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSTPIP1O43586 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSTPIP1O43586 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSTPIP1O43586 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSTPIP1O43586 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSTPIP1O43586 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSTPIP1O43586 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PSTPIP1O43586 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PSTPIP1O43586 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSTPIP1O43586 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSTPIP1O43586 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSTPIP1O43586 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSTPIP1O43586 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSTPIP1O43586 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSTPIP1O43586 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSTPIP1O43586 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSTPIP1O43586 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSTPIP1O43586 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSTPIP1O43586 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSTPIP1O43586 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSTPIP1O43586 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSTPIP1O43586 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PSTPIP1O43586 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSTPIP1O43586 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms