Protein–RNA interactions for Protein: O43497

CACNA1G, Voltage-dependent T-type calcium channel subunit alpha-1G, humanhuman

Predictions only

Length 2,377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1GO43497 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 SNHG17-208ENST00000456953 546 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 AC027139.1-201ENST00000565286 951 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 FAM86KP-201ENST00000509817 987 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 AC093567.1-201ENST00000590649 877 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 AL138720.1-201ENST00000629853 778 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 HDAC8-204ENST00000373560 819 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 AL138731.1-201ENST00000452624 739 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 AC103808.3-201ENST00000579714 598 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CACNA1GO43497 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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