Protein–RNA interactions for Protein: J3KSC0

LINC01387, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01387, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01387J3KSC0 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LINC01387J3KSC0 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LINC01387J3KSC0 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LINC01387J3KSC0 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LINC01387J3KSC0 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LINC01387J3KSC0 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LINC01387J3KSC0 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LINC01387J3KSC0 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LINC01387J3KSC0 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LINC01387J3KSC0 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LINC01387J3KSC0 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LINC01387J3KSC0 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LINC01387J3KSC0 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LINC01387J3KSC0 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LINC01387J3KSC0 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC01387J3KSC0 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC01387J3KSC0 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC01387J3KSC0 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC01387J3KSC0 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC01387J3KSC0 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC01387J3KSC0 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC01387J3KSC0 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC01387J3KSC0 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC01387J3KSC0 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC01387J3KSC0 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC01387J3KSC0 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC01387J3KSC0 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC01387J3KSC0 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC01387J3KSC0 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC01387J3KSC0 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC01387J3KSC0 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC01387J3KSC0 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC01387J3KSC0 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC01387J3KSC0 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC01387J3KSC0 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC01387J3KSC0 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC01387J3KSC0 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC01387J3KSC0 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC01387J3KSC0 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC01387J3KSC0 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC01387J3KSC0 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC01387J3KSC0 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC01387J3KSC0 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC01387J3KSC0 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC01387J3KSC0 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC01387J3KSC0 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC01387J3KSC0 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC01387J3KSC0 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC01387J3KSC0 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC01387J3KSC0 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC01387J3KSC0 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC01387J3KSC0 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC01387J3KSC0 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC01387J3KSC0 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC01387J3KSC0 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC01387J3KSC0 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC01387J3KSC0 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC01387J3KSC0 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC01387J3KSC0 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC01387J3KSC0 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC01387J3KSC0 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC01387J3KSC0 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC01387J3KSC0 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC01387J3KSC0 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC01387J3KSC0 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC01387J3KSC0 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC01387J3KSC0 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC01387J3KSC0 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC01387J3KSC0 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC01387J3KSC0 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC01387J3KSC0 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC01387J3KSC0 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC01387J3KSC0 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC01387J3KSC0 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC01387J3KSC0 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC01387J3KSC0 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC01387J3KSC0 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC01387J3KSC0 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC01387J3KSC0 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC01387J3KSC0 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC01387J3KSC0 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC01387J3KSC0 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC01387J3KSC0 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC01387J3KSC0 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC01387J3KSC0 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC01387J3KSC0 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC01387J3KSC0 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC01387J3KSC0 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC01387J3KSC0 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC01387J3KSC0 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC01387J3KSC0 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC01387J3KSC0 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC01387J3KSC0 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC01387J3KSC0 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC01387J3KSC0 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC01387J3KSC0 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC01387J3KSC0 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LINC01387J3KSC0 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LINC01387J3KSC0 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LINC01387J3KSC0 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms