Protein–RNA interactions for Protein: B4DGG1

cDNA FLJ60496, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DGG1 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
B4DGG1 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
B4DGG1 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
B4DGG1 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
B4DGG1 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
B4DGG1 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
B4DGG1 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
B4DGG1 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
B4DGG1 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
B4DGG1 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
B4DGG1 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
B4DGG1 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
B4DGG1 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
B4DGG1 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
B4DGG1 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
B4DGG1 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
B4DGG1 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
B4DGG1 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
B4DGG1 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
B4DGG1 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
B4DGG1 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
B4DGG1 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
B4DGG1 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
B4DGG1 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
B4DGG1 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
B4DGG1 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
B4DGG1 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
B4DGG1 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
B4DGG1 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
B4DGG1 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
B4DGG1 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
B4DGG1 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
B4DGG1 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
B4DGG1 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
B4DGG1 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
B4DGG1 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
B4DGG1 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
B4DGG1 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
B4DGG1 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
B4DGG1 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
B4DGG1 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
B4DGG1 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
B4DGG1 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
B4DGG1 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
B4DGG1 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
B4DGG1 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
B4DGG1 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
B4DGG1 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
B4DGG1 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
B4DGG1 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
B4DGG1 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
B4DGG1 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
B4DGG1 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
B4DGG1 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
B4DGG1 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
B4DGG1 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
B4DGG1 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
B4DGG1 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
B4DGG1 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
B4DGG1 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
B4DGG1 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
B4DGG1 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
B4DGG1 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
B4DGG1 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
B4DGG1 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
B4DGG1 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
B4DGG1 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
B4DGG1 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
B4DGG1 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
B4DGG1 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
B4DGG1 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
B4DGG1 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
B4DGG1 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
B4DGG1 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
B4DGG1 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
B4DGG1 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
B4DGG1 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
B4DGG1 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
B4DGG1 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
B4DGG1 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
B4DGG1 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
B4DGG1 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
B4DGG1 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
B4DGG1 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
B4DGG1 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
B4DGG1 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
B4DGG1 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
B4DGG1 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
B4DGG1 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
B4DGG1 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
B4DGG1 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
B4DGG1 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
B4DGG1 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
B4DGG1 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
B4DGG1 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
B4DGG1 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
B4DGG1 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
B4DGG1 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
B4DGG1 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
B4DGG1 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.2 ms