Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
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LINC00587B1AMM8 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC12.09□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
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LINC00587B1AMM8 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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LINC00587B1AMM8 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
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LINC00587B1AMM8 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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