Protein–RNA interactions for Protein: A6NNP5

CCDC169, Coiled-coil domain-containing protein 169, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC169A6NNP5 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC169A6NNP5 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC169A6NNP5 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC169A6NNP5 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC169A6NNP5 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC169A6NNP5 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC169A6NNP5 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC169A6NNP5 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC169A6NNP5 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC169A6NNP5 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC169A6NNP5 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC169A6NNP5 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC169A6NNP5 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC169A6NNP5 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC169A6NNP5 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC169A6NNP5 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC169A6NNP5 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC169A6NNP5 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC169A6NNP5 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC169A6NNP5 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC169A6NNP5 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC169A6NNP5 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC169A6NNP5 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC169A6NNP5 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC169A6NNP5 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC169A6NNP5 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC169A6NNP5 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC169A6NNP5 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC169A6NNP5 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC169A6NNP5 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC169A6NNP5 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC169A6NNP5 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC169A6NNP5 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC169A6NNP5 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC169A6NNP5 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC169A6NNP5 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC169A6NNP5 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC169A6NNP5 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC169A6NNP5 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC169A6NNP5 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC169A6NNP5 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC169A6NNP5 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC169A6NNP5 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC169A6NNP5 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC169A6NNP5 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC169A6NNP5 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC169A6NNP5 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC169A6NNP5 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC169A6NNP5 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC169A6NNP5 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC169A6NNP5 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC169A6NNP5 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC169A6NNP5 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC169A6NNP5 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC169A6NNP5 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC169A6NNP5 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC169A6NNP5 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC169A6NNP5 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC169A6NNP5 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC169A6NNP5 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC169A6NNP5 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC169A6NNP5 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC169A6NNP5 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC169A6NNP5 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC169A6NNP5 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC169A6NNP5 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC169A6NNP5 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC169A6NNP5 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC169A6NNP5 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC169A6NNP5 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC169A6NNP5 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC169A6NNP5 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC169A6NNP5 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC169A6NNP5 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC169A6NNP5 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC169A6NNP5 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC169A6NNP5 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC169A6NNP5 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC169A6NNP5 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC169A6NNP5 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC169A6NNP5 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC169A6NNP5 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC169A6NNP5 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC169A6NNP5 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC169A6NNP5 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC169A6NNP5 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC169A6NNP5 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC169A6NNP5 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC169A6NNP5 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC169A6NNP5 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC169A6NNP5 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC169A6NNP5 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC169A6NNP5 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC169A6NNP5 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC169A6NNP5 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC169A6NNP5 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC169A6NNP5 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC169A6NNP5 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC169A6NNP5 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC169A6NNP5 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms