Protein–RNA interactions for Protein: A5PLK6

RGSL1, Regulator of G-protein signaling protein-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,076 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGSL1A5PLK6 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RGSL1A5PLK6 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RGSL1A5PLK6 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RGSL1A5PLK6 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RGSL1A5PLK6 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RGSL1A5PLK6 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RGSL1A5PLK6 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RGSL1A5PLK6 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RGSL1A5PLK6 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RGSL1A5PLK6 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RGSL1A5PLK6 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RGSL1A5PLK6 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RGSL1A5PLK6 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RGSL1A5PLK6 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RGSL1A5PLK6 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RGSL1A5PLK6 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RGSL1A5PLK6 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RGSL1A5PLK6 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RGSL1A5PLK6 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RGSL1A5PLK6 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RGSL1A5PLK6 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RGSL1A5PLK6 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RGSL1A5PLK6 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RGSL1A5PLK6 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RGSL1A5PLK6 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RGSL1A5PLK6 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RGSL1A5PLK6 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RGSL1A5PLK6 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RGSL1A5PLK6 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RGSL1A5PLK6 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RGSL1A5PLK6 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RGSL1A5PLK6 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RGSL1A5PLK6 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RGSL1A5PLK6 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RGSL1A5PLK6 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RGSL1A5PLK6 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RGSL1A5PLK6 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RGSL1A5PLK6 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RGSL1A5PLK6 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RGSL1A5PLK6 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RGSL1A5PLK6 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RGSL1A5PLK6 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RGSL1A5PLK6 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RGSL1A5PLK6 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RGSL1A5PLK6 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RGSL1A5PLK6 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RGSL1A5PLK6 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RGSL1A5PLK6 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RGSL1A5PLK6 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RGSL1A5PLK6 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RGSL1A5PLK6 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RGSL1A5PLK6 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RGSL1A5PLK6 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RGSL1A5PLK6 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RGSL1A5PLK6 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RGSL1A5PLK6 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RGSL1A5PLK6 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RGSL1A5PLK6 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RGSL1A5PLK6 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RGSL1A5PLK6 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RGSL1A5PLK6 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RGSL1A5PLK6 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RGSL1A5PLK6 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RGSL1A5PLK6 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RGSL1A5PLK6 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RGSL1A5PLK6 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RGSL1A5PLK6 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RGSL1A5PLK6 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RGSL1A5PLK6 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RGSL1A5PLK6 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RGSL1A5PLK6 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RGSL1A5PLK6 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RGSL1A5PLK6 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RGSL1A5PLK6 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RGSL1A5PLK6 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RGSL1A5PLK6 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RGSL1A5PLK6 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RGSL1A5PLK6 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RGSL1A5PLK6 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RGSL1A5PLK6 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RGSL1A5PLK6 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RGSL1A5PLK6 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RGSL1A5PLK6 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RGSL1A5PLK6 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RGSL1A5PLK6 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RGSL1A5PLK6 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RGSL1A5PLK6 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RGSL1A5PLK6 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RGSL1A5PLK6 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RGSL1A5PLK6 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RGSL1A5PLK6 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RGSL1A5PLK6 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RGSL1A5PLK6 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RGSL1A5PLK6 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RGSL1A5PLK6 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RGSL1A5PLK6 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RGSL1A5PLK6 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RGSL1A5PLK6 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RGSL1A5PLK6 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RGSL1A5PLK6 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms