Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX8Q9Y5X2 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms