Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5S1

TRPV2, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 2, humanhuman

Predictions only

Length 764 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPV2Q9Y5S1 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRPV2Q9Y5S1 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRPV2Q9Y5S1 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRPV2Q9Y5S1 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRPV2Q9Y5S1 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRPV2Q9Y5S1 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRPV2Q9Y5S1 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRPV2Q9Y5S1 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRPV2Q9Y5S1 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRPV2Q9Y5S1 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRPV2Q9Y5S1 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRPV2Q9Y5S1 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRPV2Q9Y5S1 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRPV2Q9Y5S1 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRPV2Q9Y5S1 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRPV2Q9Y5S1 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRPV2Q9Y5S1 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRPV2Q9Y5S1 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRPV2Q9Y5S1 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRPV2Q9Y5S1 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRPV2Q9Y5S1 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRPV2Q9Y5S1 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRPV2Q9Y5S1 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRPV2Q9Y5S1 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRPV2Q9Y5S1 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRPV2Q9Y5S1 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRPV2Q9Y5S1 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRPV2Q9Y5S1 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TRPV2Q9Y5S1 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TRPV2Q9Y5S1 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRPV2Q9Y5S1 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRPV2Q9Y5S1 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRPV2Q9Y5S1 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRPV2Q9Y5S1 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TRPV2Q9Y5S1 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRPV2Q9Y5S1 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRPV2Q9Y5S1 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRPV2Q9Y5S1 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRPV2Q9Y5S1 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRPV2Q9Y5S1 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRPV2Q9Y5S1 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRPV2Q9Y5S1 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRPV2Q9Y5S1 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRPV2Q9Y5S1 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRPV2Q9Y5S1 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRPV2Q9Y5S1 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRPV2Q9Y5S1 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRPV2Q9Y5S1 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRPV2Q9Y5S1 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRPV2Q9Y5S1 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRPV2Q9Y5S1 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRPV2Q9Y5S1 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRPV2Q9Y5S1 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRPV2Q9Y5S1 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRPV2Q9Y5S1 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRPV2Q9Y5S1 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRPV2Q9Y5S1 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TRPV2Q9Y5S1 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRPV2Q9Y5S1 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRPV2Q9Y5S1 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRPV2Q9Y5S1 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRPV2Q9Y5S1 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRPV2Q9Y5S1 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRPV2Q9Y5S1 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TRPV2Q9Y5S1 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRPV2Q9Y5S1 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRPV2Q9Y5S1 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRPV2Q9Y5S1 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRPV2Q9Y5S1 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRPV2Q9Y5S1 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRPV2Q9Y5S1 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRPV2Q9Y5S1 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TRPV2Q9Y5S1 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRPV2Q9Y5S1 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRPV2Q9Y5S1 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRPV2Q9Y5S1 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRPV2Q9Y5S1 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRPV2Q9Y5S1 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRPV2Q9Y5S1 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRPV2Q9Y5S1 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRPV2Q9Y5S1 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRPV2Q9Y5S1 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRPV2Q9Y5S1 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRPV2Q9Y5S1 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRPV2Q9Y5S1 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRPV2Q9Y5S1 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRPV2Q9Y5S1 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRPV2Q9Y5S1 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRPV2Q9Y5S1 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRPV2Q9Y5S1 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRPV2Q9Y5S1 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRPV2Q9Y5S1 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRPV2Q9Y5S1 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRPV2Q9Y5S1 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRPV2Q9Y5S1 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRPV2Q9Y5S1 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRPV2Q9Y5S1 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRPV2Q9Y5S1 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRPV2Q9Y5S1 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRPV2Q9Y5S1 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms