Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X0

MED16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, humanhuman

Predictions only

Length 877 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED16Q9Y2X0 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms