Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV0

CEP164, Centrosomal protein of 164 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP164Q9UPV0 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CEP164Q9UPV0 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CEP164Q9UPV0 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CEP164Q9UPV0 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CEP164Q9UPV0 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CEP164Q9UPV0 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CEP164Q9UPV0 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CEP164Q9UPV0 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CEP164Q9UPV0 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CEP164Q9UPV0 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CEP164Q9UPV0 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CEP164Q9UPV0 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CEP164Q9UPV0 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CEP164Q9UPV0 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CEP164Q9UPV0 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CEP164Q9UPV0 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CEP164Q9UPV0 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CEP164Q9UPV0 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CEP164Q9UPV0 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CEP164Q9UPV0 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CEP164Q9UPV0 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CEP164Q9UPV0 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CEP164Q9UPV0 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CEP164Q9UPV0 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CEP164Q9UPV0 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CEP164Q9UPV0 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CEP164Q9UPV0 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CEP164Q9UPV0 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CEP164Q9UPV0 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CEP164Q9UPV0 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CEP164Q9UPV0 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CEP164Q9UPV0 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CEP164Q9UPV0 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CEP164Q9UPV0 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CEP164Q9UPV0 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CEP164Q9UPV0 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CEP164Q9UPV0 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CEP164Q9UPV0 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CEP164Q9UPV0 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CEP164Q9UPV0 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CEP164Q9UPV0 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CEP164Q9UPV0 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CEP164Q9UPV0 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CEP164Q9UPV0 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CEP164Q9UPV0 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CEP164Q9UPV0 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CEP164Q9UPV0 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CEP164Q9UPV0 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CEP164Q9UPV0 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CEP164Q9UPV0 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CEP164Q9UPV0 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CEP164Q9UPV0 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CEP164Q9UPV0 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CEP164Q9UPV0 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CEP164Q9UPV0 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CEP164Q9UPV0 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CEP164Q9UPV0 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CEP164Q9UPV0 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CEP164Q9UPV0 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CEP164Q9UPV0 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CEP164Q9UPV0 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CEP164Q9UPV0 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CEP164Q9UPV0 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CEP164Q9UPV0 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CEP164Q9UPV0 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CEP164Q9UPV0 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CEP164Q9UPV0 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CEP164Q9UPV0 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CEP164Q9UPV0 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CEP164Q9UPV0 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CEP164Q9UPV0 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CEP164Q9UPV0 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CEP164Q9UPV0 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CEP164Q9UPV0 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CEP164Q9UPV0 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CEP164Q9UPV0 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CEP164Q9UPV0 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CEP164Q9UPV0 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CEP164Q9UPV0 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CEP164Q9UPV0 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CEP164Q9UPV0 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CEP164Q9UPV0 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CEP164Q9UPV0 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CEP164Q9UPV0 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CEP164Q9UPV0 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
CEP164Q9UPV0 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
CEP164Q9UPV0 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CEP164Q9UPV0 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CEP164Q9UPV0 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CEP164Q9UPV0 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CEP164Q9UPV0 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CEP164Q9UPV0 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CEP164Q9UPV0 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CEP164Q9UPV0 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CEP164Q9UPV0 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CEP164Q9UPV0 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CEP164Q9UPV0 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CEP164Q9UPV0 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CEP164Q9UPV0 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CEP164Q9UPV0 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.7 ms