Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH7

SNX6, Sorting nexin-6, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX6Q9UNH7 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX6Q9UNH7 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX6Q9UNH7 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX6Q9UNH7 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX6Q9UNH7 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX6Q9UNH7 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX6Q9UNH7 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX6Q9UNH7 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX6Q9UNH7 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX6Q9UNH7 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX6Q9UNH7 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX6Q9UNH7 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX6Q9UNH7 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX6Q9UNH7 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX6Q9UNH7 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX6Q9UNH7 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX6Q9UNH7 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX6Q9UNH7 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX6Q9UNH7 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX6Q9UNH7 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX6Q9UNH7 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX6Q9UNH7 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX6Q9UNH7 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX6Q9UNH7 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX6Q9UNH7 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX6Q9UNH7 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX6Q9UNH7 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX6Q9UNH7 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX6Q9UNH7 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX6Q9UNH7 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX6Q9UNH7 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX6Q9UNH7 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX6Q9UNH7 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX6Q9UNH7 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX6Q9UNH7 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX6Q9UNH7 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX6Q9UNH7 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX6Q9UNH7 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX6Q9UNH7 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX6Q9UNH7 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX6Q9UNH7 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX6Q9UNH7 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX6Q9UNH7 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX6Q9UNH7 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX6Q9UNH7 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX6Q9UNH7 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX6Q9UNH7 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX6Q9UNH7 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SNX6Q9UNH7 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SNX6Q9UNH7 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SNX6Q9UNH7 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SNX6Q9UNH7 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX6Q9UNH7 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX6Q9UNH7 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX6Q9UNH7 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX6Q9UNH7 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX6Q9UNH7 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX6Q9UNH7 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX6Q9UNH7 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX6Q9UNH7 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX6Q9UNH7 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX6Q9UNH7 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX6Q9UNH7 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX6Q9UNH7 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX6Q9UNH7 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX6Q9UNH7 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX6Q9UNH7 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX6Q9UNH7 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX6Q9UNH7 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX6Q9UNH7 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX6Q9UNH7 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX6Q9UNH7 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX6Q9UNH7 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX6Q9UNH7 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX6Q9UNH7 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX6Q9UNH7 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX6Q9UNH7 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX6Q9UNH7 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX6Q9UNH7 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX6Q9UNH7 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX6Q9UNH7 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX6Q9UNH7 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX6Q9UNH7 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX6Q9UNH7 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX6Q9UNH7 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX6Q9UNH7 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX6Q9UNH7 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX6Q9UNH7 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX6Q9UNH7 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX6Q9UNH7 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX6Q9UNH7 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX6Q9UNH7 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX6Q9UNH7 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX6Q9UNH7 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX6Q9UNH7 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX6Q9UNH7 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX6Q9UNH7 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX6Q9UNH7 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX6Q9UNH7 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX6Q9UNH7 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms