Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

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Length 140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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