Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ0

VPS29, Vacuolar protein sorting-associated protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS29Q9UBQ0 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms